Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SF3B3Q15393 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SF3B3Q15393 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
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