Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDK3Q15120 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDK3Q15120 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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