Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ODF1Q14990 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms