Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD4Q14839 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD4Q14839 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
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