Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRCAPQ14761 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms