Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NEDD9Q14511 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEDD9Q14511 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEDD9Q14511 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
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