Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTTNQ14247 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTTNQ14247 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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