Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL9A3Q14050 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL9A3Q14050 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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