Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDX39BQ13838 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX39BQ13838 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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