Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFAIP1Q13829 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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TNFAIP1Q13829 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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TNFAIP1Q13829 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFAIP1Q13829 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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