Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PWP1Q13610 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms