Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PEX6Q13608 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PEX6Q13608 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms