Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
XRCC4Q13426 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
XRCC4Q13426 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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