Protein–RNA interactions for Protein: Q13231

CHIT1, Chitotriosidase-1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIT1Q13231 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CHIT1Q13231 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHIT1Q13231 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms