Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ECH1Q13011 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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