Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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