Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 BUR6YER159C 429 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 COS6YGR295C 1146 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 ARG2YJL071W 1725 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 ATP25YMR098C 1839 nt1.76□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 IOC4YMR044W 1428 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 QCR9YGR183C 201 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 LIP2YLR239C 987 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 SPO22YIL073C 2928 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 BEM2YER155C 6504 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 YDL073WYDL073W 2955 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 PRP38YGR075C 729 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 SPP382YLR424W 2127 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 TRM112YNR046W 408 nt1.75□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 PRM2YIL037C 1971 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 PRP18YGR006W 756 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 SPO13YHR014W 876 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 HIT1YJR055W 495 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 ISW2YOR304W 3363 nt1.74□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 KEI1YDR367W 666 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 SUR1YPL057C 1149 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 YBR089WYBR089W 600 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 MES1YGR264C 2256 nt1.73□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 YER085CYER085C 522 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 VMA10YHR039C-A 345 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 SPC3YLR066W 555 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 NPR1YNL183C 2373 nt1.72□□□□□ -2.13
TY1B-BLQ12490 IPT1YDR072C 1584 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 TIM9YEL020W-A 264 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YGL069CYGL069C 465 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YGR011WYGR011W 327 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 VHR1YIL056W 1923 nt1.71□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 ALE1YOR175C 1860 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 PUF2YPR042C 3228 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 CDC25YLR310C 4770 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 RIX1YHR197W 2292 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 RRP42YDL111C 798 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YOL162WYOL162W 648 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YIL166CYIL166C 1629 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 CTR86YCR054C 1692 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YEL1YBL060W 2064 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YPK3YBR028C 1578 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 HFM1YGL251C 3564 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 SLM4YBR077C 489 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YTH1YPR107C 627 nt1.7□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YGL193CYGL193C 312 nt1.69□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 OST5YGL226C-A 261 nt1.69□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 RRP8YDR083W 1179 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YGL117WYGL117W 798 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 HCH1YNL281W 462 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 SET4YJL105W 1683 nt1.68□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 RPN5YDL147W 1338 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 SPE1YKL184W 1401 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 DFG16YOR030W 1860 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 RIF1YBR275C 5751 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 RAV2YDR202C 1056 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 MIG2YGL209W 1149 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 PPE1YHR075C 1203 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 CBP6YBR120C 489 nt1.67□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 PRP3YDR473C 1410 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 ENP2YGR145W 2124 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 VMA22YHR060W 546 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 PET309YLR067C 2898 nt1.66□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 RTT105YER104W 627 nt1.65□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 YNL046WYNL046W 519 nt1.65□□□□□ -2.14
TY1B-BLQ12490 SUB1YMR039C 879 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 MET18YIL128W 3099 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YGR160WYGR160W 612 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 CDA2YLR308W 939 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 MCT1YOR221C 1083 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YBR134WYBR134W 402 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YMR1YJR110W 2067 nt1.64□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 NOP56YLR197W 1515 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 PRP16YKR086W 3216 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 URB2YJR041C 3525 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 UTP6YDR449C 1323 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 HKR1YDR420W 5409 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 FMP16YDR070C 282 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 RPS0BYLR048W 759 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YJL070CYJL070C 2667 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 IST2YBR086C 2841 nt1.63□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YHR145CYHR145C 357 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 INP1YMR204C 1263 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YNL203CYNL203C 612 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YPL071CYPL071C 471 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 NPL6YMR091C 1308 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 SRO9YCL037C 1305 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 YHR097CYHR097C 1101 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 UIP3YAR027W 708 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 VPS71YML041C 843 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 NDJ1YOL104C 1059 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 UBP16YPL072W 1500 nt1.62□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 RKM1YPL208W 1752 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 MAD1YGL086W 2250 nt1.61□□□□□ -2.15
TY1B-BLQ12490 DIA2YOR080W 2199 nt1.61□□□□□ -2.15
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