Protein–RNA interactions for Protein: Q12470

TY1A-NL2, Transposon Ty1-NL2 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL2Q12470 YER158CYER158C 1722 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 PRK1YIL095W 2433 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YGR242WYGR242W 309 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 HSF1YGL073W 2502 nt5.01□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 ICL1YER065C 1674 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 SKG3YLR187W 3081 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 KIN82YCR091W 2163 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 ATO3YDR384C 828 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 RPS8BYER102W 603 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 RPS21BYJL136C 264 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 RPS4AYJR145C 786 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YAR064WYAR064W 300 nt5□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 ARO2YGL148W 1131 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 VPS55YJR044C 423 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 ATP22YDR350C 2055 nt4.99□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 LAS21YJL062W 2493 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 RPL35AYDL191W 363 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 FRQ1YDR373W 573 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YAE1YJR067C 426 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 VPS1YKR001C 2115 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YBL053WYBL053W 375 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 AMD1YML035C 2433 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 MCM2YBL023C 2607 nt4.98□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 UBX7YBR273C 1311 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 COG8YML071C 1824 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 SNX41YDR425W 1878 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 VTC1YER072W 390 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YER187WYER187W 426 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 AIM46YHR199C 933 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YHR212CYHR212C 336 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YAR060CYAR060C 336 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 HPF1YOL155C 2904 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 YJR030CYJR030C 2238 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 PTR3YFR029W 2037 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 COX1Q0045 1605 nt4.97□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 SKM1YOL113W 1968 nt4.96□□□□□ -1.61
TY1A-NL2Q12470 ELP2YGR200C 2367 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YHL042WYHL042W 453 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 URM1YIL008W 300 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 SSP120YLR250W 705 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YOL046CYOL046C 675 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 BIT2YBR270C 1638 nt4.96□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 DBP6YNR038W 1890 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YDR340WYDR340W 303 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 BAT1YHR208W 1182 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 RAD27YKL113C 1149 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 SAP30YMR263W 606 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YMR326CYMR326C 309 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YNL179CYNL179C 438 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 SAP155YFR040W 3009 nt4.95□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 ORC2YBR060C 1863 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 ATM1YMR301C 2073 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 APC5YOR249C 2058 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 IGO2YHR132W-A 396 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YIL102CYIL102C 306 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 STM1YLR150W 822 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YNL010WYNL010W 726 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 PRM1YNL279W 1986 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 EXO70YJL085W 1872 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.94□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 TAF7YMR227C 1773 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 AAP1YHR047C 2571 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 PIF1YML061C 2580 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 PAU2YEL049W 363 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 MRP8YKL142W 660 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YOR050CYOR050C 348 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 SGO1YOR073W 1773 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 RIM20YOR275C 1986 nt4.93□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 HTA1YDR225W 399 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YDR442WYDR442W 393 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 FMP10YER182W 735 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 OLI1Q0130 231 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YKL111CYKL111C 336 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 AAD15YOL165C 432 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 NUT2YPR168W 474 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 FRE4YNR060W 2160 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 OCA5YHL029C 2040 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 LCB4YOR171C 1875 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YNR073CYNR073C 1509 nt4.92□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 PDI1YCL043C 1569 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 PEX6YNL329C 3093 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 MPS3YJL019W 2049 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 MZM1YDR493W 372 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 RPL37AYLR185W 267 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YMR252CYMR252C 405 nt4.91□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 TIF4631YGR162W 2859 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 IKS1YJL057C 2004 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YDR061WYDR061W 1620 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 AVT3YKL146W 2079 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 ARN2YHL047C 1863 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YHR182WYHR182W 2358 nt4.9□□□□□ -1.62
TY1A-NL2Q12470 YDR250CYDR250C 276 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL2Q12470 MTC3YGL226W 372 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL2Q12470 GRS1YBR121C 2004 nt4.9□□□□□ -1.63
TY1A-NL2Q12470 STB2YMR053C 2553 nt4.9□□□□□ -1.63
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