Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 MON2YNL297C 4911 nt1.79□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 ATP25YMR098C 1839 nt1.78□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 MES1YGR264C 2256 nt1.78□□□□□ -2.12
SMC4Q12267 CTM1YHR109W 1758 nt1.77□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 UTP5YDR398W 1932 nt1.77□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.77□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 PET100YDR079W 336 nt1.77□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.77□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 UBP16YPL072W 1500 nt1.77□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 IRC6YFR043C 714 nt1.76□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.76□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 POM152YMR129W 4014 nt1.76□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 CDC53YDL132W 2448 nt1.76□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 ROM2YLR371W 4071 nt1.76□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 DOP1YDR141C 5097 nt1.76□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 SPO22YIL073C 2928 nt1.76□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 MMS22YLR320W 4365 nt1.75□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YCR050CYCR050C 309 nt1.75□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 SAC3YDR159W 3906 nt1.75□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 PUF2YPR042C 3228 nt1.75□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 VPS15YBR097W 4365 nt1.75□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 IPT1YDR072C 1584 nt1.75□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 SKI8YGL213C 1194 nt1.74□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YIL086CYIL086C 309 nt1.74□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YNL046WYNL046W 519 nt1.74□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 RNH70YGR276C 1662 nt1.74□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YMR1YJR110W 2067 nt1.74□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YDR336WYDR336W 945 nt1.74□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YBR089WYBR089W 600 nt1.74□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 MRPL27YBR282W 441 nt1.74□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 SEC3YER008C 4011 nt1.73□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 PBI1YPL272C 1554 nt1.73□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 IOC4YMR044W 1428 nt1.73□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 RRP8YDR083W 1179 nt1.73□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 SPC3YLR066W 555 nt1.73□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 SPT7YBR081C 3999 nt1.72□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 YEL1YBL060W 2064 nt1.72□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 DIA2YOR080W 2199 nt1.72□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 HCH1YNL281W 462 nt1.72□□□□□ -2.13
SMC4Q12267 MED1YPR070W 1701 nt1.71□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 SEC15YGL233W 2733 nt1.71□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YDL073WYDL073W 2955 nt1.71□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 MRPL9YGR220C 810 nt1.71□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 PPE1YHR075C 1203 nt1.71□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 PET127YOR017W 2403 nt1.71□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 PAN2YGL094C 3348 nt1.7□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 SPC110YDR356W 2835 nt1.7□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 RPL1BYGL135W 654 nt1.7□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 COX13YGL191W 390 nt1.7□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 PRP18YGR006W 756 nt1.7□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YBL073WYBL073W 312 nt1.7□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 RPL1AYPL220W 654 nt1.7□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 CHC1YGL206C 4962 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 NUP145YGL092W 3954 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 IMG2YCR071C 441 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 SNF11YDR073W 510 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 HTD2YHR067W 843 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YOL162WYOL162W 648 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 VHR1YIL056W 1923 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 OCT1YKL134C 2319 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YJR003CYJR003C 1560 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 RPN5YDL147W 1338 nt1.69□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 OTU2YHL013C 924 nt1.68□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt1.68□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 VPH2YKL119C 648 nt1.68□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 MRPL44YMR225C 297 nt1.68□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 SPE1YKL184W 1401 nt1.68□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 EAF1YDR359C 2949 nt1.68□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 ZRG17YNR039C 1818 nt1.68□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 FMP16YDR070C 282 nt1.67□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 RPN9YDR427W 1182 nt1.67□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 RTT105YER104W 627 nt1.67□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YPS5YGL259W 498 nt1.67□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.67□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 SUR1YPL057C 1149 nt1.67□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YPL071CYPL071C 471 nt1.67□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 SMC4YLR086W 4257 nt1.67□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.67□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 PRP38YGR075C 729 nt1.66□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 VMA10YHR039C-A 345 nt1.66□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YNL203CYNL203C 612 nt1.66□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 GPI17YDR434W 1605 nt1.66□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.66□□□□□ -2.14
SMC4Q12267 URB2YJR041C 3525 nt1.65□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 RLF2YPR018W 1821 nt1.65□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 AIM18YHR198C 966 nt1.65□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 SOK1YDR006C 2706 nt1.65□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 BEM2YER155C 6504 nt1.65□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 BIR1YJR089W 2865 nt1.64□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 TPK3YKL166C 1197 nt1.64□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 NAM7YMR080C 2916 nt1.63□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 NOP56YLR197W 1515 nt1.63□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.63□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 ALE1YOR175C 1860 nt1.63□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 YCK3YER123W 1575 nt1.63□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 RIX1YHR197W 2292 nt1.63□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 YLR050CYLR050C 486 nt1.63□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 YLR366WYLR366W 306 nt1.63□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 RPL16BYNL069C 597 nt1.63□□□□□ -2.15
SMC4Q12267 TRM112YNR046W 408 nt1.63□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.7 ms