Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZGT2

NEXN, Nexilin, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXNQ0ZGT2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NEXNQ0ZGT2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NEXNQ0ZGT2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms