Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNL1Q0VF96 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CGNL1Q0VF96 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CGNL1Q0VF96 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms