Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CD47Q08722 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CD47Q08722 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CD47Q08722 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CD47Q08722 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms