Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
CHRNDQ07001 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHRNDQ07001 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRNDQ07001 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms