Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PAX8Q06710 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms