Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 YCR023CYCR023C 1836 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 CAF4YKR036C 1932 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 GPI8YDR331W 1236 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 ARO2YGL148W 1131 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 Q0143Q0143 153 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 ROK1YGL171W 1695 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 UBP12YJL197W 3765 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YCK2YNL154C 1641 nt4.72□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 ICR1ICR1 3199 nt4.71□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 GPR1YDL035C 2886 nt4.71□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 NAM2YLR382C 2685 nt4.71□□□□□ -1.65
HDA3Q06623 YER023C-AYER023C-A 213 nt4.71□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 CGR1YGL029W 363 nt4.71□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt4.71□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 HYR1YIR037W 492 nt4.71□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 URA10YMR271C 684 nt4.71□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 LAS21YJL062W 2493 nt4.71□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 DAP2YHR028C 2457 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 PIN4YBL051C 2007 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YER158CYER158C 1722 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YGR125WYGR125W 3111 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 BBC1YJL020C 3474 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YFL063WYFL063W 456 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 VPS29YHR012W 849 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YBL028CYBL028C 321 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 RPL18AYOL120C 561 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 MIP6YHR015W 1980 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 DOA1YKL213C 2148 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 VAC14YLR386W 2643 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 NOT5YPR072W 1683 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 ISW2YOR304W 3363 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YCK3YER123W 1575 nt4.7□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 OAF3YKR064W 2592 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 NOP6YDL213C 678 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 ATP17YDR377W 306 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 CAJ1YER048C 1176 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 MSL1YIR009W 336 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YLR230WYLR230W 306 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 ECM15YBL001C 315 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 ATG33YLR356W 594 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 HOP1YIL072W 1818 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YAP1802YGR241C 1707 nt4.69□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 GMC1YDR506C 1827 nt4.68□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YER076W-AYER076W-A 348 nt4.68□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YFR054CYFR054C 579 nt4.68□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YJL182CYJL182C 318 nt4.68□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 DGK1YOR311C 873 nt4.68□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 snR51snR51 107 nt4.68□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 SEG2YKL105C 3399 nt4.68□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YPS6YIR039C 1614 nt4.68□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 TDA1YMR291W 1761 nt4.68□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 TIF4631YGR162W 2859 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 PCA1YBR295W 3651 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 CDC36YDL165W 576 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YDR133CYDR133C 336 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YEL075CYEL075C 369 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 ISD11YER048W-A 285 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 RPS4AYJR145C 786 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 RPL9BYNL067W 576 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YOL114CYOL114C 609 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 IDH2YOR136W 1110 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 TDA7YNL176C 1911 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 MET12YPL023C 1974 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 MPS3YJL019W 2049 nt4.67□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 PUB1YNL016W 1362 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 CLF1YLR117C 2064 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 IRC10YOL015W 1761 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YDR442WYDR442W 393 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YIL012WYIL012W 342 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 AIM26YKL037W 357 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 SSN8YNL025C 972 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 HSP10YOR020C 321 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 RAD16YBR114W 2373 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 ATG21YPL100W 1491 nt4.66□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 SBE2YDR351W 2595 nt4.65□□□□□ -1.66
HDA3Q06623 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt4.65□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YGL152CYGL152C 678 nt4.65□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.65□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 OST6YML019W 999 nt4.65□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.65□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.65□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 BEM4YPL161C 1902 nt4.64□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 REB1YBR049C 2433 nt4.64□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 RSC3YDR303C 2658 nt4.64□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt4.64□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 ECM34YHL043W 513 nt4.64□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 PFD1YJL179W 330 nt4.64□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt4.64□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 RPS7BYNL096C 573 nt4.64□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 UTP25YIL091C 2166 nt4.64□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 PGM2YMR105C 1710 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YBP1YBR216C 2025 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YEL1YBL060W 2064 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 EBS1YDR206W 2655 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 YIR040CYIR040C 333 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 PET191YJR034W 327 nt4.63□□□□□ -1.67
HDA3Q06623 RPL15AYLR029C 615 nt4.63□□□□□ -1.67
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