Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABPB1Q06547 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABPB1Q06547 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABPB1Q06547 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GABPB1Q06547 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABPB1Q06547 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABPB1Q06547 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABPB1Q06547 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABPB1Q06547 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABPB1Q06547 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABPB1Q06547 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABPB1Q06547 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms