Protein–RNA interactions for Protein: Q06102

YTH1, mRNA 3'-end-processing protein YTH1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTH1Q06102 YGL039WYGL039W 1047 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 YKL069WYKL069W 543 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 YAL065CYAL065C 387 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 OST6YML019W 999 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 YAF9YNL107W 681 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 YNL276CYNL276C 396 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 YOR282WYOR282W 321 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 YOR331CYOR331C 558 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 DIB1YPR082C 432 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 TFB2YPL122C 1542 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 RPN3YER021W 1572 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 AEP1YMR064W 1557 nt2.91□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 PKP2YGL059W 1476 nt2.9□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 DAL5YJR152W 1632 nt2.9□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 CTM1YHR109W 1758 nt2.9□□□□□ -1.94
YTH1Q06102 SHQ1YIL104C 1524 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 LST4YKL176C 2487 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YDR149CYDR149C 708 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 SDC1YDR469W 528 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 GPP2YER062C 753 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 RTS3YGR161C 792 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 VMA10YHR039C-A 345 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 CFD1YIL003W 882 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 ECM4YKR076W 1113 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 AFB1YLR040C 675 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 TIR2YOR010C 756 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 SEN54YPL083C 1404 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 NRP1YDL167C 2160 nt2.9□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 DOA4YDR069C 2781 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 PAM1YDR251W 2493 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YFL015CYFL015C 495 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 CRG1YHR209W 876 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 NNT1YLR285W 786 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YNL043CYNL043C 321 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 RRT16YNL105W 429 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 GRE2YOL151W 1029 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YPL035CYPL035C 348 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YPL197CYPL197C 414 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 ROX1YPR065W 1107 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YPR077CYPR077C 372 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 SSE2YBR169C 2082 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 RPA135YPR010C 3612 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 EXO5YBR163W 1758 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 AKR1YDR264C 2295 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YNR063WYNR063W 1824 nt2.89□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 GDI1YER136W 1356 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 MSL5YLR116W 1431 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 Q0032Q0032 291 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 BIG1YHR101C 1008 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 LSM1YJL124C 519 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YJL169WYJL169W 369 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YJR079WYJR079W 330 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YKL083WYKL083W 615 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 PDP3YLR455W 915 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 BET5YML077W 480 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 RPL13BYMR142C 600 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 AFT2YPL202C 1251 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 PHO88YBR106W 567 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YPR022CYPR022C 3402 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 MNR2YKL064W 2910 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 TRS120YDR407C 3870 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 LCB5YLR260W 2064 nt2.88□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 FUN12YAL035W 3009 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 CDC55YGL190C 1581 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 BMS1YPL217C 3552 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 PAU10YDR542W 363 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 PAU11YGL261C 363 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 PAU13YHL046C 363 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 RNH203YLR154C 333 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YKE2YLR200W 345 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 PAU4YLR461W 363 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YOR082CYOR082C 342 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YOR203WYOR203W 354 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YPR096CYPR096C 303 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 CMD1YBR109C 444 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 ASI1YMR119W 1875 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 HAA1YPR008W 2085 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 MSR1YHR091C 1932 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 IOC3YFR013W 2364 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 SEC6YIL068C 2418 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 GYP6YJL044C 1377 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 STE24YJR117W 1362 nt2.87□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 MAK21YDR060W 3078 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 AHC2YCR082W 387 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 OPI6YDL096C 327 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 MFA1YDR461W 111 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 USE1YGL098W 738 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YAL004WYAL004W 648 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 ABM1YJR108W 372 nt2.86□□□□□ -1.95
YTH1Q06102 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 85.1 ms