Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 YCT1YLL055W 1596 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YDR018CYDR018C 1191 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 MRH1YDR033W 963 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 HLR1YDR528W 1272 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YEL075CYEL075C 369 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YKL069WYKL069W 543 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 ATP19YOL077W-A 207 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 RBL2YOR265W 321 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 DRS2YAL026C 4068 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 PCI8YIL071C 1335 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 VAC8YEL013W 1737 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 MED1YPR070W 1701 nt2.88□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 GYL1YMR192W 2163 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YDR220CYDR220C 294 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 RPF1YHR088W 888 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YET1YKL065C 621 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YKE2YLR200W 345 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YAR069CYAR069C 294 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 COX14YML129C 213 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 MSN1YOL116W 1149 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 SHG1YBR258C 429 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 ICR1ICR1 3199 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.87□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 SRP68YPL243W 1800 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YME2YMR302C 2553 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YLR278CYLR278C 4026 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 RVS161YCR009C 798 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YDL050CYDL050C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YHL005CYHL005C 393 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 GIC1YHR061C 945 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 SYS1YJL004C 612 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YJR157WYJR157W 363 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YLR076CYLR076C 423 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 GRE2YOL151W 1029 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YPR177CYPR177C 372 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 PSP1YDR505C 2526 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 FLO11YIR019C 4104 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 BNI4YNL233W 2679 nt2.86□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 SLU7YDR088C 1149 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 SAE2YGL175C 1038 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 VMA21YGR105W 234 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YGR290WYGR290W 444 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YIL175WYIL175W 318 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 RPL17BYJL177W 555 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 RIM9YMR063W 720 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 TSR4YOL022C 1227 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 CUR1YPR158W 759 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 snR35snR35 204 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 TRS20YBR254C 528 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 DPB3YBR278W 606 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 GEA1YJR031C 4227 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.85□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 PBP4YDL053C 558 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YFH7YFR007W 1062 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 SDL1YIL167W 633 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 BET4YJL031C 984 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YLR379WYLR379W 375 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 SEC14YMR079W 915 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 ATG3YNR007C 933 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 RPC40YPR110C 1008 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 MET5YJR137C 4329 nt2.84□□□□□ -1.95
RRN11Q04712 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YER138CYER138C 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YER160CYER160C 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YJR027WYJR027W 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YML039WYML039W 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YML045WYML045W 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YMR050CYMR050C 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 DNA2YHR164C 4569 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 ORC1YML065W 2745 nt2.84□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YDR239CYDR239C 2364 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 RED1YLR263W 2484 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YCR013CYCR013C 648 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 snR84snR84 550 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 snR9snR9 187 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 HPA3YEL066W 540 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 PRE1YER012W 597 nt2.83□□□□□ -1.96
RRN11Q04712 RPB9YGL070C 369 nt2.83□□□□□ -1.96
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