Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4A11Q02928 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4A11Q02928 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYP4A11Q02928 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYP4A11Q02928 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CYP4A11Q02928 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms