Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RPL6Q02878 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RPL6Q02878 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms