Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IRF8Q02556 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IRF8Q02556 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms