Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DSC2Q02487 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DSC2Q02487 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms