Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN2Q02246 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms