Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RHDQ02161 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RHDQ02161 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RHDQ02161 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RHDQ02161 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RHDQ02161 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms