Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPIBQ01892 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPIBQ01892 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms