Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAP1Q01518 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CAP1Q01518 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms