Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PDE1BQ01064 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PDE1BQ01064 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms