Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PKD1P98161 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PKD1P98161 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PKD1P98161 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PKD1P98161 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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