Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP2P81877 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SSBP2P81877 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms