Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LMO4P61968 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO4P61968 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms