Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVFC1P60507 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVFC1P60507 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms