Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA3P59666 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA3P59666 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA3P59666 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA3P59666 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA3P59666 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DEFA3P59666 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DEFA3P59666 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms