Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GJA9P57773 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GJA9P57773 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GJA9P57773 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GJA9P57773 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA9P57773 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA9P57773 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA9P57773 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA9P57773 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA9P57773 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GJA9P57773 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA9P57773 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA9P57773 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA9P57773 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA9P57773 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA9P57773 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA9P57773 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA9P57773 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GJA9P57773 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms