Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EEFSECP57772 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EEFSECP57772 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms