Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTBP2P56545 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTBP2P56545 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms