Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCKAP1LP55160 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1LP55160 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms