Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA2D1P54289 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA2D1P54289 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms