Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PGGT1BP53609 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PGGT1BP53609 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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