Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRE11P49959 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRE11P49959 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRE11P49959 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRE11P49959 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRE11P49959 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms