Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF6P49848 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TAF6P49848 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TAF6P49848 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TAF6P49848 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TAF6P49848 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6P49848 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6P49848 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6P49848 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6P49848 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TAF6P49848 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TAF6P49848 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms